Suzume, una chica de 17 años que vive en un tranquilo pueblo de Kyushu, conoce a un joven en un viaje "en busca de puertas". Suzume lo sigue hasta las ruinas de un edificio en ruinas en las montañas y encuentra una puerta independiente e intacta, como si solo "eso" se salvara de la devastación. Suzume se siente atraída por un poder invisible y se acerca a la puerta. Pronto, las puertas de todo Japón comienzan a abrirse una tras otra. Las puertas que se abrieron deben cerrarse para dejar fuera la calamidad que se encuentra al otro lado. -Estrellas, atardecer y el cielo de la mañana. Los lugares por los que deambula tienen un cielo en el que todas las horas del día parecen mezclarse. Llamada por las puertas misteriosas, comienza el "viaje de las puertas que se cierran" de Suzume.